#1 02-08-2011 19:15:37

Polynesia
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Correlizer@home

L'organisation séquentielle des génomes, c'est à dire les relations entre les paires de bases éloignées et les régions au sein des séquences, et sa connexion à l'organisation tridimensionnelle des génomes est encore un problème largement non résolus. Longue distance en loi de puissance des corrélations ont été trouvées en utilisant une analyse de corrélation sur presque toute l'échelle observables de 132 chromosomes entièrement séquencé de 0,5? 106 à 3,0? 107 pb des Archaea, Bacteria, Arabidopsis thaliana, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Drosophila melanogaster, et Homo sapiens. Les coefficients de corrélation locales montrent un comportement spécifique des espèces multi-échelle: près de corrélations aléatoires à l'échelle de quelques paires de bases, un premier maximum de 40 à 3400 pb (pour Arabidopsis thaliana et chez Drosophila melanogaster divisé en deux submaxima), et souvent une région d'une ou plusieurs secondes maxima de 105 à 3? 105 pb. Au sein de ce comportement d'échelle multi-, un montant supplémentaire de structure fine est présente et imputables à l'usage des codons dans tous, sauf les séquences humaines, où elle est liée à la liaison des nucléosomes. Séquences générées par ordinateur aléatoire en supposant un bloc d'organisation des génomes, l'usage des codons, et contraignant nucléosomiques expliquer ces résultats. Mutation par remaniement séquence détruit toutes les corrélations. Ainsi, la stabilité des corrélations semble être étroitement contrôlé et évolutif lié à l'organisation du génome spatiale, en particulier sur de grandes échelles. En résumé, les génomes montrent une organisation complexe séquentielle étroitement liée à leur organisation en trois dimensions.

L'application a été développée aux Pays-Bas à l'Erasmus Medical Center de Rotterdam et distibuted jeté le Erasmus Grille Bureau

    Papier
    Contactez Anis Abuseiris, Tobias A. Knoch

Url du projet : http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelber … /index.php

Url pour s'attacher : http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/

Il y a des applications pour tout le monde et pas mal de taf apparemment....

Dernière modification par Polynesia (02-08-2011 19:18:59)


http://goo.gl/pY0Zp * PRPNet (PSA): 3 716 000 + 47 primes

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#2 02-08-2011 19:42:01

Damien
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Re: Correlizer@home

Je n'ai pas compris grand chose, mais suis inscrit wavey


http://statseb.boinc-af.org/signature.py?cpid=e0e2727fa560e6a5151e797a0600ee64

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#3 03-08-2011 04:34:09

frederic abussan
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Re: Correlizer@home

Moi aussi big_smile


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#4 03-08-2011 10:13:08

Damien
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Re: Correlizer@home

frederic abussan a écrit:

Moi aussi big_smile

...et bientôt tout en haut du classement, comme d'habitude wink


http://statseb.boinc-af.org/signature.py?cpid=e0e2727fa560e6a5151e797a0600ee64

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#5 03-08-2011 16:18:02

frederic abussan
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Re: Correlizer@home

heu......je me suis gourré de tag...donc a voir  ([ yikes


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#6 07-08-2011 05:14:01

frederic abussan
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Re: Correlizer@home

On retroue Tobias sur ce projet tongue


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#7 07-08-2011 05:34:35

Damien
Prince of Flood
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Re: Correlizer@home

frederic abussan a écrit:

On retrouve Tobias sur ce projet tongue

Non, cette fois c'est un "docteur Tobias A. Knoch" smiley1074 qui est mentionné en page d'accueil de Correlizer, ce ne peut donc pas être le jeune Tobias fumeurs9 de FreeHal.

Dernière modification par Damien (07-08-2011 05:42:01)


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#8 07-08-2011 07:07:58

frederic abussan
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Re: Correlizer@home

Luc je suis tom pere celebrit  1079


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#9 07-08-2011 13:13:53

Polynesia
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Re: Correlizer@home

tonguehappy_38happy_38happy_38


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