#1 01-10-2009 21:02:07

frederic abussan
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[Biomédical] EvoGrid

Pour bientot

Projet en préparation  http://www.evogrid.org/



http://images3.hiboox.com/images/4009/11984d2cb57d3821bb9b14d908e16b1b.jpg



En Octobre, une petite équipe de chercheurs de la Silicon Valley prévoit de transformer le logiciel à l'origine idiotçu pour rechercher des signes de vie extraterrestre à la tâche de recherche de preuves de vie artificielle générée sur une grappe d'ordinateurs à haute performance.

L'effort, surnommé le EvoGrid, Est une idée originale et prépare une thèse de doctorat de Bruce Damer, un informaticien de la Silicon Valley qui développe des logiciels de simulation pour la NASA dans une entreprise, Digital Space, basée à Santa Cruz, Californie

M. Bale et son ingénieur en chef, Peter Newman, sont la modélisation de leurs efforts après le projet SETI @ Home, qui a débuté par le Search for Extraterrestrial Intelligence ou SETI, programme visant à rendre l'utilisation de centaines de milliers d'ordinateurs connectés à Internet dans les foyers et des bureaux. Le projet fait de ces petits ordinateurs en un supercalculateur vastes en utilisant un logiciel de reconnaissance des formes sur des ordinateurs individuels à passer en revue une grande quantité de données pour chercher des traces de signaux très affaiblis provenant d'autres civilisations dans le cosmos.

EvoGrid L'objectif est de déceler des preuves de comportement d'auto-organisation dans des simulations informatiques qui ont été construits pour modéliser la première apparition de la vie dans le monde physique. Logiciel de reconnaissance de formes sur les ordinateurs de la maison semble être un outil parfait.

Le projet est un nouvel effort dans le domaine de l'ordinateur de la recherche fondée sur la vie artificielle, qui a généré beaucoup d'intérêt chez les informaticiens et des biologistes dans les années 1980 et les années 90, mais décliné comme un progrès rapides ont été accomplis en biologie synthétique. Dans la dernière décennie, les chercheurs ont commencé à modifier le matériel génétique pour des applications comme la drogue et la croissance des carburants. De nombreux scientifiques estiment le domaine est proche de la synthèse de la vie biologique à partir de matières de base.

Digital Research vie artificielle est basée sur l'œuvre originale de Stanislaw Ulam et John von Neumann à Los Alamos laboratoire au cours des années 1940. Von Neumann posé l'idée d'un automate cellulaire, essentiellement une matrice de cellules, comme les cases d'un échiquier. Chaque cellule peut représenter des états simples comme sur et en dehors, en créant un treillis de l'évolution constante qui pourrait être programmé avec des règles simples dans un ordinateur.

Plus tard, les chercheurs de vie artificielle créé des programmes pour tirer parti de la puissance croissante des ordinateurs à l'évolution de modèle dans un langage simple, des univers abstrait. Tierra, en particulier, d'abord développée par l'écologiste Thomas Ray dans les années 1990, a attiré beaucoup d'attention. Le programme, qui s'est déroulée sur plus de 100 postes de travail, a démontré la mutation des formes numériques et les aspects élémentaires de l'évolution. Plus récemment, Spore, de Will Wright, popularisé de nombreux aspects de la vie artificielle dans un jeu qui est maintenant largement disponible sur les ordinateurs de bureau, consoles de jeux vidéo et même des iPhones.

Pourtant, malgré l'intérêt généralisé, le terrain a eu du mal à échapper à la critique tels que la modélisation des «univers jouet" mai être intellectuellement intéressante, mais n'est pas susceptible de créer des formulaires avec les propriétés numériques incroyablement complexes de la vie biologique.

"Tous les 10 ans quelqu'un revivre ces systèmes", a déclaré George Dyson, un historien des sciences, qui inquiète les EvoGrid mai être réinventer la roue.

Le projet a aussi ses défenseurs.

"Mon attitude est, nous allons donner à l'hypothèse forte de la vie artificielle une chance», a déclaré Richard Gordon, un radiologue à l'Université du Manitoba, qui a beaucoup écrit sur le sujet et est conseiller auprès du projet.

Répondeur sceptiques, M. Bale a dit que par des systèmes de couplage beaucoup plus puissant de calcul que précédemment disponibles, avec potentiellement des dizaines, voire des centaines de milliers de PC à base d'observateurs, les EvoGrid pourrait permettre de détecter les comportements émergents. «Le principal défi, dit-il,« n'est pas la génération d'une sorte d'interaction moléculaire roman. Plutôt, c'est l'analyse et en essayant de voir ce qui se passe. "

Pour construire rapidement le EvoGrid, les chercheurs s'appuient sur deux projets open-source software.

BOINC est un système financé par la National Science Foundation qui utilise Internet pour permettre aux scientifiques de tirer profit des cycles de calcul disponible gratuitement sur le réseau d'ordinateurs connectés. La semaine dernière, par exemple, le système était composé de plus de 500.000 ordinateurs qui a généré une moyenne de près de 2,45 petaflops de puissance informatique. En revanche, en Juin de cette année, le supercalculateur le plus puissant du monde, construite par IBM à Los Alamos National Laboratories, produit 1,1 petaflops.

Pour simuler l'évolution numérique, le EvoGrid utilisera un deuxième programme, Gromacs, développé à l'Université de Groningue aux Pays-Bas, de modéliser des interactions moléculaires. EvoGrid chercheurs espèrent créer un modèle informatique qui reproduit l'océan tôt et puis l'utiliser comme un véritable «soupe primordiale» à évoluer rapidement formes numériques.

Simulations de logiciels qui peuvent évolution modèle pourrait être utilisé par les concepteurs de l'homme, a fait valoir M. Damer. "Nous ne pouvons pas construire des voitures et des avions ou même les jouets de nos jours sans la modélisation et la simulation informatique, at-il dit. "Alors pourquoi pas la biochimie?


http://statseb.boinc-af.org/signature.py?cpid=95f64d953ce337ccb7cb9b36f03d3250

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#2 01-10-2009 21:12:30

gilloox
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Re: [Biomédical] EvoGrid

Bref, combien de points/Heure ?

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#3 01-10-2009 23:16:58

Viny
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Re: [Biomédical] EvoGrid

Gilloox a tout résumé avec la question qui tue.  happy_38

ON VEUT DES CREDITS  :euro:


++
Viny
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#4 02-10-2009 04:35:50

frederic abussan
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Re: [Biomédical] EvoGrid

Autant que pour Planetquest happy_38


http://statseb.boinc-af.org/signature.py?cpid=95f64d953ce337ccb7cb9b36f03d3250

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#5 24-09-2010 21:06:46

Polynesia
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Re: [Biomédical] EvoGrid

j'y comprends rien, il est toujours d'actus ce projet ? si oui on participe comment ?


http://goo.gl/pY0Zp * PRPNet (PSA): 3 716 000 + 47 primes

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#6 25-09-2010 13:38:14

tibidao
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Re: [Biomédical] EvoGrid

C'est un projet en phase d'esquisse encore, comme planetquest. Aucune application, aucune date, aussi bien ça va jamais calculer. Wait and see.


http://statseb.fr/signature.py?cpid=6077c10f49432aafd06c2d68a5156623

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#7 25-09-2010 13:47:15

Polynesia
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Re: [Biomédical] EvoGrid

ok merci


http://goo.gl/pY0Zp * PRPNet (PSA): 3 716 000 + 47 primes

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#8 19-05-2011 16:51:17

Polynesia
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Re: [Biomédical] EvoGrid

Je viens de up les autres exécutables. Donc comme d'habitude: OS X (32/64bits), Linux (32/64bits), Windows (32bits).

Les unités devraient durer un peu moins longtemps qu'avant. Normalement la consommation RAM est tjrs sensiblement la même.
Pas de point de sauvegarde.
Et la progression affichée dans le Manager est très très approximative.
En gros ça fait qq chose du genre: 0 -> 1,8 -> 3,6 -> blocke pdt qq minutes -> progression +- linéaire jusque 60 ou 70% de mémoire -> blocke pdt qq minutes -> 100%

Sauf nouveau problème, va y avoir des unités en continu jusqu'au 1premier minimum.

Ah et j'allais oublié, comme mentionné précédemment, le bug sous Linux est résolu smile

Merci de mettre ce projet en bio....


http://goo.gl/pY0Zp * PRPNet (PSA): 3 716 000 + 47 primes

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#9 19-05-2011 20:31:53

frederic abussan
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Re: [Biomédical] EvoGrid

Si vous le dites c'est fait 1079


http://statseb.boinc-af.org/signature.py?cpid=95f64d953ce337ccb7cb9b36f03d3250

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#10 19-05-2011 20:40:49

Polynesia
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Re: [Biomédical] EvoGrid

frederic abussan a écrit:

Si vous le dites c'est fait 1079

allhail


http://goo.gl/pY0Zp * PRPNet (PSA): 3 716 000 + 47 primes

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#11 01-06-2011 17:10:18

Polynesia
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Re: [Biomédical] EvoGrid

deux articles intéressants sur le portail....tongue


http://goo.gl/pY0Zp * PRPNet (PSA): 3 716 000 + 47 primes

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#12 02-06-2011 15:56:14

Damien
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Re: [Biomédical] EvoGrid

Polynesia a écrit:

deux articles intéressants sur le portail....tongue

p+1


http://statseb.boinc-af.org/signature.py?cpid=e0e2727fa560e6a5151e797a0600ee64

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